修剪苗木的方法主要包括以下幾個方面：
不同苗木的修剪順序。落葉喬木的修剪應遵循先疏枝後短截、先剪大枝後剪中等枝再剪小枝的順序；園林果樹類則應先拉枝再疏枝後短截；灌木類一般應由內向外先疏後剪；叢球、綠籬、色塊類的植物應先短截後疏枝。
修剪工具。常用的修剪工具有剪枝剪、手鋸、修枝鋸等。
修剪方法。輕短截主要用於花、果類樹木強壯枝的修剪，刺激下部芽萌發；中短截用於弱樹復壯和主枝延長枝的培養；重短截用於弱樹、弱枝的更新復壯修剪；極重短截主要用於更新復壯，剪去枝條的百分之八十左右；疏枝從枝條或枝組的基部將其全部剪去，使留下來的枝生長勢增強。
不同季節的修剪量。春季疏除枝條總量的1/4左右；夏季疏除枝條總量的1/3左右，保留20%左右的健壯葉片；秋季疏除枝條總量的1/3左右，並保留20%左右的健壯葉片。
修剪順序。先大後小，先內後外，先上後下。
修剪時的注意事項。保護主軸頂芽，不可抹頭；對於觀賞整體規則樹形的修剪，要疏內留外，短截頭枝促進發枝生長；對於常綠樹，原則上不做修剪，只對受傷枝、病蟲枝進行修剪。
此外，修剪苗木時還需要注意樹木的生長狀況和健康狀況，選擇合適的修剪方法和工具，以及遵循正確的修剪順序和注意事項。