原生孔隙是指在沉積和成巖過程中形成的孔隙，這些孔隙在岩石形成後未受到任何物理或化學作用的影響。主要包括以下幾種類型：
粒間孔隙。這是指顆粒之間未被灰泥或膠結物充填的孔隙，如內碎屑、生物碎屑、鱺粒等顆粒之間的孔隙。
粒內孔隙。這是指碳酸鹽巖顆粒內部的孔隙，通常指生物體腔孔隙，即生物死亡後，軟體組織部分腐爛分解，體腔未被全部充填而保存下來的孔隙。
生物骨架孔隙。這是指由生物骨架（如貝殼、骨骼等）形成的孔隙。
遮蔽孔隙。這是指由較大生物殼體、碎片或其他顆粒的遮擋而形成的孔隙。
這些孔隙在砂岩、碳酸鹽巖等沉積岩中較爲常見，對岩石的物理性質（如孔隙度、滲透率等）有重要影響。