可可粉和可可脂主要在製作方法、營養成分和用途方面有所區別。具體如下：
製作方法不同。可可粉是通過將可可豆烘焙後，移除可可脂的部分，將殘留部分研磨成粉末狀而生產的；可可脂則是在可可豆中含有的油脂部分，通過壓榨等工藝提取出來的。
營養成分不同。可可粉中含有一定的纖維素和蛋白質，而不含脂肪和膽固醇，而且它還含有碳水化合物、蛋白質以及少量的纖維素，是一箇很好的熱量來源；可可脂含有高達60%的脂肪，包括單不飽和脂肪酸和多不飽和脂肪酸，它們可以提供大量的能量。
用途不同。可可粉主要用於烘焙、糕點、巧克力、熱巧克力飲料等方面；可可脂主要應用於製作巧克力、糖果、麪點、油脂等食品方面，此外，由於可可脂的低融點，它也是很多化妝品和護膚品的必要成分。