製作咖啡渣堆肥的方法有多種，以下是一些常見的方法：
乾性堆肥：將咖啡渣置於陽臺，每日翻攪，約十日後可放入盆栽內。
溼性堆肥：將咖啡渣置於陽臺，不去翻攪，數日後待其佈滿黴菌，再與沙土攪拌後放入盆栽內。
熱堆肥：混合咖啡渣、菜市場收集的魚腸和椰糠，用鏟子翻拌，儘量混合均勻。卷好袋口，以免蒼蠅進入產卵。幾天後，它會持續高溫發酵。
加入紅糖：將紅糖加入咖啡渣裏，攪拌混合，加少量水。用袋子密封起來，放至陰涼通風處，等待2~3個月就可以取出來用。
透氣編織袋：把咖啡渣裝進可透氣的編織袋裏，放在太陽不會直射的地方。兩三天後咖啡渣裏所含的高量碳水化合物開始分解，咖啡渣開始發熱。等到發熱3-4天后，每天不斷加入新渣，並翻攪舊咖啡渣，讓沒發熱的咖啡渣有機會發熱。
與土混合：咖啡渣發酵的時候可以和土摻在一起。比例可以是1:1，發酵三個月左右就可以使用了。
需要注意的是，咖啡渣必須發酵，否則會對植物造成傷害。此外，咖啡渣並不適合所有的植物，千萬不要給不喜歡氮化物的植物。