《囮物語》的故事主要圍繞著女高中生櫻野窩野花展開。花在某一天發現自己的房間內出現了一隻被捕鳥人（一種日本傳說中的生物）捕獲並企圖飼養的烏鴉。花試圖拯救這隻烏鴉，卻發現它已經死亡。這個事件引發了一系列關於自然、生命和人類與自然界的關係的思考。
此外，花的好朋友小琉也在這個故事中扮演了重要的角色。小琉是一個神秘的女孩，她對各種怪談和傳說非常了解。她幫助花理解了捕鳥人和烏鴉的故事，並引導花面對自己的恐懼和不安。
總的來說，《囮物語》是一個關於自然、生命和成長的故事，同時也包含了許多日本傳統民間故事和傳說的元素。