磨墨的方法主要包括以下幾個步驟：
在硯堂上面滴少量清水。
將墨條垂直置於硯堂上，重按輕轉，順時針研磨，要緩、要輕。古人所謂的“磨墨如病夫”就突出了一箇“緩”字。
在研磨過程中根據墨的濃稠情況，分次加入清水。要有耐心，研磨得太快墨汁容易起沫，太慢則下墨遲。
如需大量墨汁，可將磨好的墨汁倒入墨海中，然後繼續研磨。也可將現成的瓶裝墨汁倒入硯臺，加水，用墨條研磨一段時間，調和使用。
宿墨滯筆，如果沒有特殊的使用習慣，要及時洗淨硯臺。
此外，磨墨的方式有多種，可以根據自己的習慣和硯臺的形制選擇自己喜歡的磨墨方式，不能死搬硬套。例如，如果墨錠體量較大，用墨量也大，可以用斜磨的方式；如果是小於10釐米的小墨條，用墨量較小，則可以用平磨的方式。