大薸的防治方法主要包括以下幾種：
入藥。大薸可以用於外用敷治無名腫毒，煮水後可用於洗滌汗瘢、血熱作癢，以及消除跌打腫痛。煎水內服可以通經、治療水腫、小便不利、汗皮疹、臁瘡和水蠱。
化學防治。使用對水生生物、水源及其他伴生有益植物安全的化學除草劑進行噴施，這種方法相對環保，但需要注意選擇對水體影響小的化學藥劑。
生物防治。利用大薸的天敵大薸葉象進行防治。這種方法環保，但需謹慎引入天敵，以防引進新的入侵物種。
此外，還有物理打撈方法，通過人工或機器打撈來控制大薹的數量，這種方法雖然費時費力，但不會對水體產生二次危害，是目前主要採用的方法。