奇亞籽和亞麻籽在多箇方面存在差異：
脂肪含量和種類不同。亞麻籽的脂肪含量較高，約爲34%-42%，富含Omega-3脂肪酸，尤其是亞麻酸；奇亞籽的脂肪含量略低，約爲31%-34%，也含有Omega-3脂肪酸，但相對較少。
纖維含量不同。奇亞籽的纖維含量較高，每100克中含有大約34克纖維；亞麻籽的纖維含量約爲27克。
蛋白質含量不同。奇亞籽的蛋白質含量略高，每100克中含有約16克蛋白質；亞麻籽的蛋白質含量約爲18克。
抗氧化物質不同。兩者都含有豐富的抗氧化物質，如維生素E和多酚類化合物，有助於抵抗自由基損傷，保護細胞免受氧化應激。
礦物質含量不同。奇亞籽和亞麻籽都富含礦物質，如鈣、鎂、磷和鋅等，有助於維持骨骼健康、神經功能和免疫系統功能。
口感不同。奇亞籽在浸泡後會形成一層膠狀物，口感略微類似於布丁或果凍；亞麻籽的口感相對較嫩，有一定的咬勁。
烹飪方式不同。奇亞籽可以作爲配料直接添加到飲品、酸奶、果醬等食物中，也可以用於製作布丁、果凍等甜點；亞麻籽可以直接添加到早餐穀物、酸奶、沙拉、麪包等食物中，也可用於製作能量球、堅果糖等小食品。
外觀不同。亞麻籽的表面有一層薄薄的白色纖維，而奇亞籽則更加光滑。