彈塗魚主要通過鰓來呼吸。
彈塗魚在水中時，會像大多數魚類一樣使用鰓來攝取氧氣。然而，彈塗魚還具有一些獨特的呼吸機制，使它們能夠在離開水面的情況下生存。以下是彈塗魚的呼吸方式：
彈塗魚可以通過皮膚和口腔黏膜來攝取空氣中的氧氣。這種方式允許它們在陸地上呼吸。
彈塗魚會將水儲存在腮幫子裏，保持鰓周圍的水溼潤。這樣，即使是在陸地上，它們也能通過鰓從空氣中吸收氧氣。
彈塗魚的皮膚和尾巴下佈滿毛細血管，有助於氣體交換，這使它們即使在乾燥環境中也能進行呼吸。爲了保持皮膚的溼潤，彈塗魚會在灘塗上打滾，以保持皮膚的溼潤狀態。
這些機制共同使彈塗魚成爲能夠在水中和陸地上都能生存的魚類。