根據提供的搜尋結果，御三家排行榜的排名如下：
火系御三家寶可夢實力排名：
噴火龍：作為初代御三家寶可夢小火龍的最終進化型，噴火龍擁有火屬性和飛行屬性。它以其高出場頻率和強大的實力而聞名，特別是在《XY》篇中能夠進行Mega超進化，擁有兩種超進化形態X和Y。超級噴火龍X形態甚至能擁有龍系屬性，使其在所有火系御三家寶可夢中排名第一。
火焰雞：火系與格鬥系寶可夢，首次登場於無印篇。火焰雞以其強大的速攻能力而著稱，特別是在Mega超進化後，其作戰能力得到極大提升。它的表現足以證明其排在烈焰猴之前。
烈焰猴：同樣是火系加格鬥系的寶可夢，但缺少了Mega超進化的能力。儘管如此，烈焰猴在小智手中的表現依然出色，擁有猛火特性，能瞬間提升攻擊力。如果擁有Mega超進化能力，它的排名可能會更高。
草系御三家寶可夢實力排名：
蜥蜴王：豐緣地區的草系御三家寶可夢，木守宮的最終進化型。蜥蜴王以其一流的速度和凌厲的招式著稱，在《XY》篇中不僅能進行Mega超進化，還增加了龍屬性，實力和速度都有顯著提升，因此在所有草系御三家寶可夢中排名第一。
妙蛙花：搜尋結果中未提供關於妙蛙花的詳細信息或排名。
請注意，搜尋結果中未提供關於水系御三家寶可夢的排名信息。