微生物是一類體積微小、肉眼難以直接觀察到的生物體，包括細菌、病毒、真菌、放線菌、立克次氏體、支原體、衣原體、螺旋體等。
這些生物體廣泛存在於自然界中，與人類的生活密切相關，對健康、醫藥、工農業、環保等領域都有重要影響。微生物的體積非常小，有些可以用肉眼看見，如真菌中的蘑菇等，而其他如病毒則是由核酸和蛋白質等少數幾種成分組成的非細胞生物。
病毒雖然由核酸和蛋白質組成，但它們不能獨立生存，必須依賴於活細胞才能生存。微生物在自然界中幾乎無處不在，它們的存在形式多樣，包括空間微生物、海洋微生物等，根據細胞結構的不同，又可以分為原核微生物和真核微生物。