整改未完成的原因主要包括以下幾點：
問題事項時間跨度較長：某些問題可能因為歷史遺留而需要較長時間來解決，導致整改難以在短期內完成。
責任主體利益未觸及：如果整改效果不直接觸及責任主體的根本利益，責任主體可能不會給予足夠的重視，從而影響整改的積極性和效率。
責任意識不高：責任意識不強可能是由於企業文化或制度執行不到位造成的。當制度不被嚴格執行，久而久之，責任意識就會減弱。
責任劃分不清：當整改責任的劃分不明確時，可能會導致責任主體之間的推諉，進而影響整改的順利進行。
整改要求與實際情況有差距：有時候，被審計單位雖然想整改，但受限於現實條件（如人力成本、編制限制等），無法完全滿足審計部門的要求，導致整改難以徹底完成。
未建立長效機制：如果沒有建立持續監控和改進的長效機制，整改可能只是一時的應對措施，無法確保問題的根本解決。
領導方式不夠科學有效：領導層的指導方式、領導作風和工作作風可能不夠深入，導致對單位建設存在的問題認識不清，從而影響整改的效果。
綜上所述，整改未完成的原因涉及責任主體的利益關聯、責任意識、責任劃分、現實條件限制、長效機制缺失以及領導方式等多個方面。解決這些問題需要從制度設計、文化建設和領導力提升等多個角度入手。