新加坡脫離馬來西亞的原因主要包括政治體制差異、種族與宗教差異、經濟差異與矛盾、李光耀因素等。以下是詳細介紹：
政治體制差異。新加坡在英國管治下實行代議政治，而馬來西亞保留君主制傳統，導致兩地政治分歧加劇。
種族與宗教差異。新加坡以華人爲主，馬來西亞以馬來人爲主，在語言、文化、宗教習俗等方面存在較大差異，導致合併後各族羣間的摩擦增加。
經濟差異與矛盾。新加坡經濟較發達，需要提供較多經濟援助給馬來西亞其他地區，這引起部分馬來西亞人不滿，同時，兩地在經濟政策上也有分歧。
李光耀因素。李光耀是新加坡首任總理，其與馬來西亞政府存在理念上的衝突，如對馬來西亞主權的看法等，導致合作關係惡化。
新加坡被視爲對馬來西亞主權的威脅。李光耀希望新加坡能夠掌握更多自治權，這被馬來西亞視爲對其主權的挑戰，進而選擇驅逐新加坡。
此外，新加坡與馬來西亞之間的種族矛盾也是一箇重要因素，如1964年發生的馬來人和華人之間的種族暴亂等事件，進一步加劇了兩地之間的關係緊張。