海膽的保存方法有多種，具體取決於是否爲活海膽以及預計的食用時間。
對於活海膽，可以使用海水保存，將其放置於裝有海水的容器中，活海膽在這樣的環境中可以存活數天，但最多不應超過三天。另外，也可以使用低溫保鮮，將活海膽放入冰箱冷藏室，但保存時間不應超過24小時。
對於已死亡的海膽，可以選擇鹽醃或酒精醃製，這兩種方法都可以減緩海膽變質的過程。此外，也可以選擇將海膽開殼去內臟後，用鹽水沖洗，再浸泡在明礬水中，之後進行烘乾控水處理，這樣處理後的海膽可以保存數月。
總的來說，活海膽應儘快食用，以確保最佳風味。對於已死亡的海膽，可以通過不同的醃製方法或加工處理來延長保存時間。在保存過程中，應注意避免接觸油脂和高溫環境，以防止變質。