陰莖短小可能由多種因素造成，包括遺傳因素、發育與營養狀況、肥胖、疾病因素（如睪丸炎、隱睪症、睪丸發育不全、內分泌不平衡、雄性激素不足等），以及包皮過長或包莖。對於陰莖短小的治療，應根據具體情況採取不同的方法，如物理治療、藥物治療、手術治療等。如果陰莖短小的同時伴有其他症狀，如性功能障礙或不育問題，應及時就醫進行詳細檢查和診斷。
此外，如果陰莖短小是由於肥胖引起的，可以通過減肥來改善。對於青少年，如果陰莖短小伴有激素分泌不足，可以在醫生指導下使用相應的藥物進行治療。在考慮任何治療方法之前，建議先諮詢專業醫生，以獲得最適合個人情況的治療建議。