《神隱少女》背後的故事主要講的是九歲時跳上初旭日，踏上尋找消失父母之路的女孩小滿，她的名字來自山海經，是一個靈獸，象徵著生命的初始和無拘無束。她在旅途中遇到了孤兒們組成的奇妙之旅團隊——除妖大師、痴傻的少女和萬年狐妖。他們被少女們中的妖氣困擾，誤入人界妖界無法返回，與少女們們展開了一場奇幻冒險之旅。在這個過程中，少女們也學會了理解與寬容，並在旅程的終點找到了各自的答案和歸宿。最終少女們成功擊退為保護自己而來的天神們，獲得了所有村民們的認同並幫助村民解決了他們內部的紛爭。
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