秘書長是一個組織或機構中的高級管理職位，主要負責協助和輔助執行機構的重要決策，承擔領導和組織協調工作，以及管理和監督機構的日常運營。
在民間組織、政府機構、政黨或國際組織等不同的機構中，秘書長通常處於較高的地位，直接向執行或指導委員會、董事會或領導層匯報。其主要職責包括協調領導處理日常事務，相當於一個組織和領導的大管家，例如協調各部門的工作，陪同領導調研等。在政府機構中，秘書長通常兼任政府辦公廳室主任，並根據工作需要任命副秘書長來協助其工作。
以聯合國為例，秘書長由安理會推薦、聯合國大會指定，是聯合國的「行政首長」，負責秘書處的工作，並負責提請安理會關注可能威脅國家和平和安全的任何事項。聯合國秘書長通常被視作聯合國的象徵，並具有相當高的道義權威。