秦姓的來源主要有以下幾個：
源於嬴姓：秦姓最早源於嬴姓，出自周孝王給伯益後裔非子的封地秦國，屬於以國名為氏。伯益是顓頊帝的後裔，因輔佐大禹治水有功，被賜姓嬴。非子善於馴馬，周孝王封非子於秦亭，為周朝附庸，今甘肅張家川東。非子的曾孫秦仲，為周宣王大夫，秦莊公繼續征討，獲勝並收復失地，被封為西垂大夫，邑犬丘，今甘肅禮縣東北。秦莊公次子秦襄公討西戎、護周平王東迂洛邑有功，被封為諸侯，並賜以岐以西之地。秦國正式建立後，子孫遂以國為氏。
源於姬姓：秦姓還源於姬姓，周武王封其弟周公於魯，周公之子伯禽裔孫食采於秦邑，子孫以邑名為氏。
外族改姓：還有一些秦姓是來自外族的改姓。
以上各支秦姓的歷史都有3000年。