穿山甲和食蟻獸之間存在幾個關鍵的區別：
科屬分類不同。穿山甲屬於鱗甲目、穿山甲科；食蟻獸則屬於貧齒目。
形態特徵不同。穿山甲體形狹長，全身覆蓋有鱗甲，四肢粗短，尾巴扁平而長；食蟻獸吻部尖長，嘴管形，前肢力強，第三指特別發達，呈鐮刀狀鉤爪。
食性不同。穿山甲的食物主要包括白蟻、螞蟻及其他昆蟲；食蟻獸則以螞蟻、白蟻及其他昆蟲爲食。
棲息環境不同。穿山甲主要生活在山麓地帶的草叢中或較潮溼的丘陵雜灌叢中，挖洞居住；食蟻獸則主要棲息於潮溼的森林和沼澤地帶，也會樹棲。
分佈區域不同。穿山甲主要分佈在東南亞及非洲的部分國家；食蟻獸則主要分佈在中美洲和南美洲從墨西哥最南端到巴西、巴拉圭的廣大地區。
這些區別使得兩者在生物分類、生理結構、生活習性等方面都有顯著的不同。