粳稻與秈稻的主要區別在於它們的適應性、植株形態、米粒形狀、出米率、米粒強度等方面。具體如下：
適應性不同。粳稻更適合生長在高緯度或低緯度的地區，比較耐寒；而秈稻則適宜生長在低緯度、低海拔的濕熱地區，更耐高溫和濕潤。
植株形態不同。粳稻植株葉色深綠，葉形窄，葉片茸毛少，莖稈低矮，分櫱性弱；秈稻植株葉色淺綠，葉形寬，葉片茸毛多，株高較高，分櫱性強。
米粒形狀不同。粳米顆粒較短而圓，橫斷面近圓形，顏色為半透明；秈米顆粒較長且扁平，顏色比粳米白。
出米率不同。粳稻出米率高，米粒強度大，耐壓性好；秈稻出米率低，米粒強度低，不耐壓。
烹飪用途不同。粳米適合製作壽司、飯糰、煲粥等；秈米適合做炒飯、煮粥等。
此外，在營養價值方面，兩者相差不大，但在口感和外觀上有明顯區別。