蘑菇的腥味通常來源於其生長環境和處理方式。自然生長的蘑菇，如紅蘑菇和榛蘑菇，可能會帶有一些土腥味，這些可以通過浸泡、沖洗和瀝乾水分來去除，從而不會掩蓋住蘑菇本身的香味。人工養殖的蘑菇，如香菇和金針菇，在培菌過程中可能會帶有一點怪味，這些怪味較難通過浸泡或沖洗去除，因此需要過水焯一下，通過高溫加工去除怪味。此外，市場上的一些罐頭類蘑菇可能經過高溫處理並添加化學添加劑，這類蘑菇通常不會有異味，但建議消費者儘量少食用，因為可能會過多攝入化學添加劑。
在烹飪蘑菇時，還可以通過加入一點醋來幫助去除腥味。需要注意的是，如果蘑菇散發出其他異味，如酸味、臭味等，這可能表明蘑菇已經腐敗變質，應立即丟棄。