處理跨年發票時，可以根據不同情況採取不同的方法。
發票在次年收到但費用在之前年度發生的情況，處理方式有：
在年度結賬時，可以先按照發票金額確認成本或費用。將發票作爲附件補充至原記賬憑證，並在收到發票的當期確認進項稅（可抵扣的專用發票）。
如果在次年彙算清繳前取得發票，可以在當年的企業所得稅彙算清繳時扣除。
若在次年彙算清繳前未取得發票，應在當年的彙算清繳時進行納稅調整，並在收到發票的年度進行追補（不超過5年）。
如果預計金額與實際發票金額存在差異，且發票時點發生在出具財務報告前，應調整當年的賬務和財務報表。若時點發生在財務報告後，則通過“以前年度損益調整”進行差錯更正。
對於特殊情況的處理，如：
預計金額與實際金額有較大差異時，可以直接計入當期損益。
屬於預付性質的發票，即使日期爲前一年，也可以計入後一年的賬目。
對於存貨採購的發票，如果在次年驗收合格後入庫，可以在次年入賬並稅前扣除。
此外，對於員工在次年報銷的情況，應通過“以前年度損益調整”科目進行覈算。