迷你鸚鵡魚可以通過以下幾個特徵來區分公母：
體型。公魚的體型通常大於母魚，母魚相對更小巧圓潤。
背鰭和臀鰭。公魚的背鰭和臀鰭末端尖銳，呈深“V”形，並可能有細長的拉絲，而母魚的背鰭和臀鰭較短小，末端可能呈鈍角或U型。
頭部後方。公魚頭部後方可能有小突起，而母魚則相對平滑。
尾鰭顏色。成年公魚的尾鰭可能呈現紅色或偏紅色，而母魚的尾鰭可能呈現黃色或黃綠色。
繁殖期特徵。進入繁殖期時，公魚和母魚的顏色和行爲表現會有所不同，公魚可能更喜歡在繁殖區域的外部空間活動，保衛魚卵和領地，而母魚則有更明顯的腹部顏色變化，如橘紅色或橘黃色的孕斑。
生殖孔形狀。公魚的生殖孔呈V形，而母魚的生殖孔則呈圓形，在繁殖期間，母魚可能會露出明顯的輸卵管。
這些特徵中，背鰭和臀鰭的形狀、頭部後方的情況以及尾鰭的顏色在某些情況下可能不夠準確，因此綜合多箇特徵來判斷會更可靠。