馬來西亞擁有多個國際機場，主要機場包括：
吉隆坡國際機場（Kuala Lumpur International Airport，IATA代碼為KUL）。位於雪蘭莪州雪邦，距離吉隆坡和布城聯邦直轄區分別約43千米和19.5千米。機場於1998年開通，擁有2座航站樓和2座衛星廳，總面積85.98萬平方米，設有242個機位和3條跑道，可滿足年旅客吞吐量7500萬人次的需求。
檳城國際機場（Penang International Airport，IATA代碼為PEN）。位於檳榔嶼州東南端的峇六拜，東北距喬治敦15千米。機場於1935年開通，是馬來西亞第一座機場。擁有54582平方米的航站樓面積，設12座登機廊橋，有民航機位25個，其中6個為貨機機位；跑道長3353米，寬45米。
亞庇國際機場（Kota Kinabalu International Airport）。位於馬來西亞沙巴州首府哥打基納巴魯市。
古晉國際機場（Kuching International Airport）。位於馬來西亞砂拉越州首府古晉市。
士乃國際機場（Senai International Airport，IATA代碼為JHB）。位於柔佛州新山市。
這些機場服務馬來西亞各個地區，滿足了不同的航空需求。