鑑別黑水晶真偽的方法包括：
觀察其內部特徵。在放大鏡下，天然黑髮晶內部髮絲相互平行，呈現出一頭大一頭小的釘管狀包裹體，管內有顏料充填，空管橫斷面為三角形。而合成發晶（假貨）的髮絲取向一致，呈釘管狀，橫斷面為三角形，這與天然發晶的特徵不同。
利用二向色性。真黑髮晶具有二向色性，而人造的黑髮晶沒有。
陽光下的表現。真黑髮晶垂直放置在陽光下時，可以發出五顏六色的光，而假水晶則不能。
硬度測試。真黑水晶的硬度較大，容易在玻璃上留下明顯的痕跡。相比之下，假冒玻璃的黑水晶在玻璃上留下的痕跡則不明顯。
氣泡觀察。在放大鏡下觀察，如果黑髮晶內部有圓形氣泡，則可能是玻璃製品所偽造的。
溫度感覺。真黑髮晶具有冬暖夏涼的特性，用手觸摸即使在炎熱夏天也會有冷感，而合成品則沒有這種特性。
觀察陽光下的物質。將黑髮晶放在陽光下，觀察其中是否含有絮狀物質或細小條紋，真黑水晶含有這些特徵，而假黑水晶（如玻璃製成的）則沒有。
檢查條紋和柳絮狀物質。對著太陽觀察真水晶時，可以看到淡淡的均勻細小的橫紋或柳絮狀物質，而假水晶沒有這些特徵。
通過以上方法，可以較為準確地鑑別黑水晶的真偽。