σ因子在RNA聚合酶的轉錄過程中發揮著關鍵作用，其主要功能包括：
模板鏈的選擇和轉錄起始：σ因子作為RNA聚合酶的別構效應物，幫助酶專一性地識別模板鏈上的啟動子，從而開始轉錄過程。
提高對啟動子區DNA序列的親和力：σ因子能夠顯著增強RNA聚合酶對啟動子區DNA序列的結合能力，使得酶與DNA的結合常數提高，從而促進RNA的合成。
降低與非特異性位點的親和力：σ因子不僅提高了酶對特定啟動子的親和力，還顯著降低了RNA聚合酶與模板DNA上非特異性位點的結合能力，確保轉錄過程的高效性和準確性。
綜上所述，σ因子通過其獨特的機制，確保了RNA聚合酶能夠準確、高效地開始轉錄過程，並在轉錄起始階段發揮關鍵作用。