丁甘仁的主要著作包括《喉痧症治概要》《孟河丁氏醫案》《藥性輯要》《醫經輯要》以及《丁甘仁醫學全集》等。其中，《醫經輯要》是一本內難經類中醫著作，包含《藏象》《經絡》《病機》《類證》《類病》《治則》《運氣》等七類，採集《內經》精要之語，逐段詳加註解。
《丁甘仁醫學全集》則分為上中下三部分，上篇醫案，主要匯集丁老典型醫案近200餘則，內容涉及內外婦兒五官等各科；中篇醫論，收集丁老醫論50餘論，較全面地反映丁老獨特的學術思想和成就；下篇方藥，從「診方輯要、丁甘仁用藥一百十三法、丁氏外科丸散膏丹驗方錄、丁甘仁家傳珍方等進行論述，充分體現了丁老臨床用藥規律和特色。