根據提供的信息，三叔的死因和情況如下：
在小說《盜墓筆記》中，三叔吳三省為了阻止禁婆的計劃，選擇自我犧牲，將自己定死在了盔甲里。這一行為是在與吳邪的共同對抗組織的過程中發生的。
然而，也有觀點認為吳三省並沒有真正死亡。小說中提到，吳三省可能並沒有死亡，而是與真正的吳三省一起轉型為背後對抗組織的力量。
此外，有說法提到吳三省在蛇沼里被蛇咬，但這一情節似乎與他的最終命運無關，因為吳三省並沒有在那裡死亡。
在《盜墓筆記》的續集《重啟》中，吳邪繼續尋找三叔的蹤跡，但最終只在雷城找到了三叔留下的幻影，這表明三叔仍然下落不明。
綜上所述，三叔在《盜墓筆記》中的死因是自我犧牲，但具體情況存在爭議。儘管有證據表明他可能並未真正死亡，但這一結論並未得到充分的證實。因此，可以認為三叔的命運仍然是《盜墓筆記》中的一個未解之謎。