乙醯胺對眼睛、皮膚、黏膜和上呼吸道有一定的刺激性。在動物實驗中，乙醯胺被證實有致癌作用。此外，乙醯胺還可燃，易爆，具有刺激性。
儘管乙醯胺的毒性較低，使用相對安全，但注射局部可能會出現疼痛，如果劑量過大或長期用藥，可能會引起血尿。然而，也有研究表明，乙醯胺可以用於治療氟乙醯胺和氟乙酸鈉等有機氟化合物中毒。
需要注意的是，二甲基乙醯胺（DMF）與乙醯胺雖然化學結構相似，但毒性特性有所不同。接觸二甲基乙醯胺產生的蒸氣時，會對皮膚黏膜產生刺激，甚至被皮膚黏膜吸收，使皮膚黏膜出現瘙癢、發紅，甚至燒灼感。還會對眼睛黏膜產生強烈刺激，使眼睛難以睜開。在進行呼吸時還會刺激到呼吸道黏膜，損壞呼吸系統，出現呼吸困難的症狀。如果長期處於二甲基乙醯胺的環境中，則會導致中樞神經系統功能障礙，可能會出現頭暈、頭痛、噁心、嘔吐、胸悶，甚至昏迷等症狀。