《人偶之匣》第二章的攻略主要包括以下幾個部分：
天平提供的線索。玩家需要將搜尋到的瓶子放到桌面上，經過天平測量，藥瓶從左向右的重量分別為5、2、3、7、1。
藥瓶的位置。剩餘的藥瓶分布在抽屜中、書櫃中、桌子上以及鞋櫃中，其中鞋櫃需要解開密碼鎖。
營養液的作用。根據藥瓶對應的數值按照33175的順序進行調配，將拿到的種子種入花盆中，導入營養液後可以長出帶有線索的花朵。
藏在暗處的秘密。關燈後可以看到散落在桌子上的螢光粉，收集後撒在照片上，可以揭示鐘錶的線索。
鐘錶隱藏的線索。根據關燈後顯示的鐘表線索，調整鐘錶的時間（將左右側相片歸為正位對應的時間）。
花朵指引的線索。根據花瓣顏色和盒子的顏色，可以得知盒子的密碼為527，打開密碼盒可以獲得棋子。
拓印密碼。使用大廳拿取的墨水在桌面上拓印，可獲得密碼鎖的密碼。
鏡子隱藏的秘密。用抹布將鏡子擦乾淨後可以看到線索9.24，結合病歷上的線索6.24和筆記本上的線索，可以獲得日期組合6.24。
人偶機關盒。根據筆記本右側頁的線索，根據長短可拼出人偶機關盒的密碼為L.C.C.L.L.C，L代表左，C代表右，打開後可以獲得圓形牌。
迷宮人偶。將棋子放到人偶上，完成迷宮後可以獲得圓形牌。
望遠鏡的用途。將保險箱上的牌子按1.2.3.4的順序排好，可以獲得望遠鏡，使用望遠鏡在窗台處眺望，可以看到桌上的玩偶。
四塊圓形牌的位置。找到四塊圓形牌後，按照望遠鏡看到的順序將圓形牌位置放好，可以獲得起居室的鑰匙。