人工合成基因的方法主要有 兩 種，以下是具 體操作：
以目的基因 轉 錄成的信使RNA 為模板，通 過反 轉 錄酶的作用合成互 補的 單 鏈DNA，然 後在酶的作用下合成 雙 鏈DNA， 從而 獲得所需的基因。 這 種方法常 用於真核生物基因的合成。
根 據已知蛋白 質的 胺基酸序列推 測出相 應的信使RNA序列，然 後依照 鹼基互 補配 對的原 則，推 測出基因的核苷酸序列，再通 過化 學方法，以 單核苷酸 為原料合成目的基因。 這 種方法 適 用於已知基因序列的情 況下。
此外， 還有一些新技 術和方法也被 套用 於基因合成，如基因表 達 載 體的 構建、 將目的基因 導入受 體 細胞等步 驟， 這些技 術可以在分子水平上 進行精 確的基因操作和改造。