人類補完計劃(Human Instrumentality Project)是《新世紀福音戰士》中的核心概念，其最終目的是通過消除人與人之間的隔閡和心之壁，實現人類的最終進化。
這個計劃源自於SEELE組織，一箇致力於人類進化的神祕組織。它包括兩個主要目標：一是通過科學手段實現人類的進化，二是通過消除人與人之間的隔閡和爭端，實現真正的和平。人類補完計劃涉及多箇層面，包括身體和靈魂的進化，以及人類社會結構的根本變革。該計劃的核心在於將所有人類的靈魂融合，迴歸到莉莉絲，從而實現人類的最終進化。
此外，該計劃也隱藏着SEEE企圖通過人類的滅亡來贖罪的目的。在《新世紀福音戰士》中，人類補完計劃被描繪爲一箇複雜且多層次的概念，涉及到人類的進化、靈魂的補全以及SEEE的贖罪心理。