房室模型是一種用於分析和描述藥物在體內動態過程的數學模型。
它基於藥物的轉運動力學特徵，將機體視為一個或多個相通的房室組成的系統，這些房室（或隔室）是基於藥物轉運的動力學特點劃分的，而不是解剖學或生理學上的固定結構或成分，房室模型中的藥物轉運速率相似的器官或組織組成一個房室，每個房室內的藥物處於動態平衡狀態，藥物在房室之間以及房室與外界環境之間的轉移或轉換滿足物質守恆定律。
根據藥物的轉運特徵和實驗數據的需要，房室模型可以分為一室模型、二室模型等，一室模型假設藥物給藥後立即在全身達到動態平衡，而二室模型則將藥物首先快速分布到血流灌注量大的器官（如心、肝、腎等），然後再向其他組織分布，這些模型有助於理解藥物在體內的吸收、分布、消除過程。