支付系統是一種金融安排，由提供支付清算服務的中介機構和實現支付指令傳送及資金清算的專業技術手段共同組成，其主要功能是實現貨幣從一方流向另一方的過程，爲經濟交往提供便捷、安全的支付手段。
支付系統有時也稱爲清算系統，它支撐各種支付工具的應用，實現資金清算並完成資金的最終轉移。按照運營主體的不同，支付系統分爲人民銀行支付系統和銀行機構支付系統等。按照對資金處理模式的不同，支付系統分爲實時全額結算系統和延遲淨額結算系統。此外，支付系統還涉及電子支付系統，這是由提供支付服務的中介機構、管理貨幣轉移的法規以及實現支付的電子信息技術手段共同組成的系統，用來清償經濟活動參加者在獲取實物資產或金融資產時所承擔的債務。