一種樹狀結構圖
進化樹（Phylogenetic tree），也稱爲系統發育樹或系統進化樹，是一種樹狀結構圖，用來表示物種間或基因間的親緣關係。
在進化樹中，節點代表生物類羣的進化歷史，外部節點代表物種，而內部節點代表假想的祖先。枝的長度可以表示祖先和後代之間的進化距離。進化樹不僅展示了生物的進化歷程，還表明瞭生物從簡單到複雜、從水生到陸生的進化趨勢。構建進化樹的過程涉及序列準備、模型選擇、建樹及樹的驗證等步驟。此外，進化樹的分析方法包括基於距離的方法（如UPGMA、ME、NJ）、基於特徵的方法（如MP、ML、BI）等。