施基肥的最佳時間是在秋季，具體而言，九月、十月和十一月是施加基肥的最佳時機。秋季是果樹營養積累的時期，此時施基肥可以增加樹體的營養貯備，有利於果園保墒蓄水，預防冬春乾旱，提高地溫，防止果樹根部凍害。此外，秋季土溫較高，墒情較好，有利於土壤微生物活動，施入的有機肥腐熟快，易被根系吸收利用。
需要注意的是，施基肥的具體時間還需根據果樹品種和當地氣候條件來確定。例如，桃、李、梅、杏、櫻桃等核果類果樹可以提前施肥，而嘎啦蘋果、紅香酥梨等中早熟品種最好在8月下旬至9月中旬施入基肥，紅富士蘋果、碭山酥梨、紅提葡萄等晚熟品種則以9月施入爲佳。
總的來說，施基肥的最佳時間是在秋季，具體爲九月、十月和十一月，但具體時間還需根據果樹品種和當地氣候條件來確定。