分支DNA是一種人工合成的DNA分子，其特點是在結構上整合了帶有被保護羥基的核苷衍生物，從而形成分支狀的寡脫氧核糖核酸。
分支DNA的原理是基於其獨特的結構特點，這種結構使得DNA分子可以形成特定的三維結構，從而在某些生物分析中具有重要的套用價值。例如，在基於分支DNA的信號放大檢測法中，利用鹼性磷酸酶標記的寡脫氧核苷酸探針，可以在組織或細胞水平上與基因或病原體核苷酸依序雜交，使雜交信號級聯放大，最終通過化學發光儀讀取發光值，並根據已知濃度標準品繪製的標準曲線，計算目標DNA的拷貝數，實現定性或定量檢測。