北京海淀區最好的國中可以歸類為以下幾所：
第一檔：包括六所學校，即人大附中、清華附中、十一學校、101中學、首師附中和北大附中。這些學校因其卓越的教育質量和生源而聞名，其中人大附中因其早期培養選拔機制和政策調整，生源質量和數量相對較高。清華附中、北大附中和101中學通過考試選拔學生，保持了相對穩定的生源。
第二檔：包括人翠中學、57中學、人航中學、十一龍樾中學、清上中學、上地實驗中學和人分中學。這些學校在海淀區具有較強的教研實力，其中人翠和人航的生源質量較好，人翠的生源以體制內子弟為主，人航的生源主要來自總裝、航天五院。
第三檔：包括十一晉元學校、首師北校和首師二附中。這些學校雖然教學進度相對較慢，但仍有一定的教學實力和生源質量。
第四檔：包括民辦錦秋中學、海外中學、師達中學和人北中學。這些學校雖然生源質量有所下降，但家長教育投入較高，使得生源相對強於全搖號區重點學校。
第五檔：包括區重點學校（不含19中）和轉公民辦學校，如北航實驗中學、20中學、交大附中、理工附中、八一中學、中關村中學、教進南北學校、建華中學和理工分校。這些學校雖然不是六小強，但也有自己的特色和教學實力。
綜上所述，北京海淀區最好的國中包括六小強和上述提到的其他學校，其中六小強因其卓越的教育質量和生源而位居海淀區國中教育的前列。