千眼菩提子的作用主要包括以下幾個方面：
改善睡眠。千眼菩提中含有較高的三萜類化合物，這些化合物能夠鎮靜安眠，提高睡眠質量，幫助緩解各類睡眠障礙。
調節血糖。千眼菩提富含黃酮類化合物，具有降血糖和調節胰島素的作用，能有效預防糖尿病，對糖尿病患者也有明顯輔助作用。
清熱解毒。千眼菩提能夠清熱解毒，對熱性疾病如口腔潰瘍、皮炎瘙癢、痘痘等有良好療效，同時提高免疫力。
佛教文化價值。千眼菩提在佛教文化中被視為聖物，相傳是千手千眼觀世音之化物，屬菩提子之上品。佩戴或把玩千眼菩提被認為有贈運辟邪的功效，能化惡解凶，被視為菩提子中的極品，具有很高的收藏價值。
精神心理作用。千眼菩提子還能起到純淨心靈、使人心神清氣爽和心情愉悅的作用。尤其對於心情容易煩躁的人來說，佩戴千眼菩提子能起到平心靜氣的作用，使心情保持愉悅。
身體按摩作用。把玩千眼菩提子能起到按摩手部的作用，由於人的手部與多處重要器官的反射區相連，這種按摩對心、肝、脾、肺、腎等器官均有好處，有助於身體健康。
升值空間。隨著時間的積累和把玩，千眼菩提子的品質會逐漸提升，光澤增加，顏色變深，這也使其具有較大的升值空間。
此外，千眼菩提子還具有預防眼疾、防治感染疾病的功效。