南京市擁有眾多知名企業，其中包括：
外資企業。如西門子數控（南京）有限公司、菲尼克斯電氣有限公司、帕萊克機械（南京）有限公司、舍弗勒（南京）有限公司等，這些企業涉及自動化、工具機控制、汽車零部件等多個領域。
國有企業。如南京華能集團、中國航發汽車技術研究院有限公司、中國科學院南京計算技術研究所等，這些企業在電力工業、汽車技術、科學研究等領域具有重要地位。
網際網路和科技公司。如蘇寧、焦點科技、三六五網路、華為南京研究所、阿里巴巴南京分公司等，這些企業在電子商務、軟體開發、通信技術等領域具有競爭優勢。
除此之外，還有許多其他類型的公司，如製造業、服務業和初創企業等，為南京市的經濟多樣性做出了貢獻。