周建人的第一位妻子是羽太芳子，她來自日本，原本是為了照顧懷有身孕的姐姐而來，但最終選擇留在周家長住。隨著時間的推移，羽太芳子與周建人互生情愫並結婚。他們的婚姻生活共育有四個子女，但不幸的是，第一個孩子夭折，第二個孩子馬理在北京唐山地震中身亡，第三個孩子周沛成為了一名教師，而第四個孩子豐三則自盡。周建人與羽太芳子的感情最初很好，但後來因工作原因分居兩地，周建人又與曾是學生的王蘊如發展了關係，最終導致與羽太芳子的離婚。
周建人與第二任妻子王蘊如的關係發展如下：
王蘊如，浙江紹興人，曾是周建人的學生。
他們的長女周曄，畢業於上海聖約翰大學英文系，曾是《工人日報》記者，後調入中央統戰部。
二女兒周瑾，畢業於上海中山醫學院，後到蘇聯留學，回國後在藥物研究所工作。
小女兒周蕖，曾在清華大學經濟系學習，後被選派到蘇聯留學，回國後在北京師範大學教育研究所擔任院長。
周建人與第二任妻子王蘊如的關係發展順利，他們的子女在各自的領域取得了顯著的成就。