土壤消毒的常見方法包括：
日光消毒。將土壤平鋪在陽光充足的地方，暴曬3至7天，利用紫外線和高溫殺死病菌和害蟲。
高溫消毒。將土壤放入塑料袋中，紮緊袋口，然後採用蒸煮、烤箱烘烤等方式進行高溫處理，持續30分鐘或更長時間。
藥物消毒。使用如多菌靈、甲基託布津等消毒劑，按說明書要求兌水後澆灌土壤，或使用熏蒸劑如溴甲烷、氯化苦等對土壤進行處理。
在進行土壤消毒時，應先清除土壤中的雜物，注意藥物的使用量和濃度，避免對植物造成傷害。化學消毒法應在通風良好的地方進行，以避免對人體造成傷害。消毒後的土壤應放置一段時間，待其自然恢復後再使用。