基因武器是一種利用基因工程技術研製的新型生物戰劑，也被稱為第三代生物戰劑。
基因武器通過基因重組和合成生物學等技術手段，對生物的遺傳物質進行操作，製造出具有特定功能或特性的微生物、毒素或病毒。這些武器可以通過將特定基因植入致病細菌或病毒中，使病原體能夠對抗普通疫苗或藥物，或者將非致病微生物轉變為致命病菌。基因武器的特殊性在於它們能夠利用人種生化特徵上的差異，使得某些致病菌只對具有特定遺傳特徵的人群產生作用，從而實現有選擇性地消滅敵方有生力量的目的。
基因武器的潛在威脅和倫理爭議引起了廣泛的關注，儘管它們可能提供前所未有的戰術優勢，但伴隨的是對人類安全、生態平衡以及國際法律和道德標準的嚴峻挑戰。