大孔雀明王心咒的作用主要包括：
治癒疾病：
能夠治療各種疾病，包括蚊蟲傳染的疾病、發熱、飲食不消化、風寒黃痰、不明原因的疾病，以及身體各部位的疼痛，如頭痛、眼耳鼻喉痛、唇口頰痛、牙齒舌痛、咽喉痛、胸脅背痛、心痛、肚痛、腰痛、腹痛、膝痛、四肢痛等。
此外，孔雀明王心咒還能淨化和調節身體的能量，使身體氣脈得到平衡，排除毒素及負面能量，有助於長壽。
化解災難：
除了治癒疾病外，大孔雀明王心咒還能祈雨、消除地震、雪災、戰爭、洪水、饑荒等自然災害。
摧伏毒害煩惱：
孔雀明王具有攝取和折伏二德，能夠摧伏毒害煩惱，滅一切惡毒，除一切毒類。
象徵斷盡一切煩惱惡毒的孔雀食一切毒蟲以維生，白蓮座表示慈悲攝取之本誓，青蓮座則象徵降伏。
增強敬愛、調伏、增益：
四種持物中，開敷蓮華象徵敬愛，俱緣果子表示調伏，吉祥果代表增益，孔雀尾有息災之意。
綜上所述，大孔雀明王心咒不僅具有治癒疾病的功效，還能化解災難，摧伏煩惱，增強敬愛、調伏和增益。這些作用體現了孔雀明王心咒在佛教中的重要地位和廣泛的套用。