保存核桃仁有多種方法，以下是詳細介紹：
乾藏核桃仁。將脫去青皮的核桃仁放置在乾燥、通風的地方晾乾，直到核桃的表皮和核桃仁不易分離，色彩一致，然後將乾燥的核桃裝在痲袋中，放在通風、陰涼、光線不直接高壓到的地方，儲藏期間要防止鼠害、霉爛和發熱。
冷藏核桃仁。將核桃仁放在痲布袋中，因為痲布袋有良好的通風透氣性能，然後放在低溫的冰櫃中冷藏，這樣可以保證核桃仁裡面的果肉組織不被氧化，達到最佳貯藏效果。
濕藏核桃仁。在地形高燥、排水良好的地方挖一條深1米、寬1—1.5米的溝，溝底先鋪一層10厘米左右厚的潔淨濕沙，然後一層核桃一層沙鋪上，溝壁和核桃之間以濕沙充填，不留空地。溝的附近開排水溝，防止雨水進入太多，造成濕度過高。如果溝長超過2米，應每隔2米豎一把紮緊的稻草作通氣孔用。
塑膠袋貯藏。將核桃仁放入塑膠袋中，然後沖入二氧化碳氣體，降低氧氣的濃度，放在低溫、低空氣濕度的環境下。