如懿的孩子死亡的原因如下：
五公主璟兕：
被魏嬿婉利用嘉嬪養的狗咬傷，後因狂犬病病逝。
十三阿哥永璟：
因胎位不正和調理差錯導致早產，後因接生嬤嬤田姥姥的暗算而窒息夭折。
永璂：
唯一倖存的兒子，但英年早逝，24歲便薨，可能因母親的原因性情大變，曾被下毒。
其他孩子：
永璟被魏嬿婉設計害死，永琪也被魏嬿婉安排的侍妾害死。
魏嬿婉的孩子出生後被交給穎嬪撫養，儘管魏嬿婉害死了自己的孩子，穎嬪並未心生怨恨。
總結：如懿的孩子死亡的原因多樣，包括疾病、早產和被害等，其中魏嬿婉的角色尤爲關鍵，她通過不同的手段害死瞭如懿的多箇孩子。