孔融的故事有很多，以下是其中兩個。
故事一：孔融小時候到訪梨園，園中有個擺放著五色黍子的特設小神壇，孔融觀察了它一會兒，回頭問眾神主人：“這裡的神像莫非是誰嗎？”他弟弟說：“是啊，這個神名叫梨。但是你怎么知道他有這個神壇的呢？”孔融說：“人們都尊敬喜愛自己的果實，更何況園的神，正是主管百果，哪一個寺觀廟宇有神像而不受先令讓四方百姓前來祭祀呢？我當然知道它了。”
故事二：孔融十歲的時候，隨父親到洛陽，當時李元禮名氣很大，做司隸校尉。中常侍趙忠屬下有個才子叫李元虎，也有很大的名氣。李元禮把來訪的人分為三等，上等叫“請”，中等叫“詣”，下等叫“將”，孔融才不過10歲，竟也“詣”之列。由此可見他在當地已小有名氣了。
這只是孔融成長故事的一部分，他的故事還有很多，這些故事展現了他過人的智慧和獨特的性格。