根據提供的信息，孟祈佑的死因和過程如下：
死因：孟祈佑在《傾世皇妃》的結局中，因為被箭射中而落入水中。這一事件發生在馬馥雅離開孟祈佑去周國找趙匡胤借兵之後。孟祈佑為了馬馥雅放棄了皇位，但在不久後的途中，遭遇了馬度雲的襲擊，導致他中箭並落入水中。
生存狀態：儘管孟祈佑落入水中，但他並沒有因此而死亡。他的水性很好，能夠在湖底救出被馬湘雲推下懸崖的馬馥雅。第一箭射中了他的胸膛右側，並非要害部位，後續的箭矢也只射中了背部。因此，落入水中是為了救自己，避免在岸上遭到馬度雲的毒手。
綜上所述，孟祈佑雖然經歷了嚴重的傷害和生命危險，但他並沒有因此而死亡。他的生存狀態和救援行為展示了他的勇敢和犧牲精神。