宇智波鼬滅族的原因是多方面的，主要包括：
保護村子免受戰亂：宇智波一族的叛變如果成功，木葉村將會遭到其他國家和忍村的入侵，導致村子遭受慘痛的打擊。鼬認爲這是爲了木葉村的安穩和防止內戰的爆發。
維護宇智波一族的名譽：如果宇智波一族真的叛變了，無論成功與否，他們都將遭到社會的輿論攻擊，被認爲是背叛村子的一族。這對於高傲的宇智波一族來說，名譽比生命更爲重要。
木葉高層的命令：鼬接受了木葉高層志村團藏的任務，誅滅全族。這是基於對村子安全的考慮，以及爲了止水的意願和弟弟的性命。
臥底任務：鼬在滅族後加入了曉組織，成爲臥底，目的是爲了保護弟弟佐助。他留下佐助並刺激他向自己復仇，以此作爲保護佐助的方式。
綜上所述，宇智波鼬滅族的決定是基於對村子的保護、維護宇智波一族的名譽、執行木葉高層的命令以及完成臥底任務的考量。這一決定背後蘊含了複雜的情感和犧牲，體現了鼬對於家族和村子的深厚情感。