小葉紫檀和黑檀木在多個方面有顯著的區別：
顏色不同。小葉紫檀通常呈紫紅色，隨著時間氧化可能會變為黑紅色，且有油亮感；黑檀木則主要表現為深色，如黑色或深棕色，具有明顯的黑白相間的紋理特徵。
硬度不同。小葉紫檀的硬度相對較高，但仍然低於黑檀木。黑檀木被認為是非常堅硬的木材之一。
紋理不同。小葉紫檀的紋理較明顯，但不如黑檀木那麼顯著；黑檀木的紋理交錯且排列均勻，而小葉紫檀的紋理細密。
氣味不同。小葉紫檀在摩擦時可能散發出一種淡淡的清香的檀香味；相比之下，黑檀木則無明顯氣味。
產地不同。小葉紫檀主要生長在非洲；而黑檀木則主要產自南亞和東南亞。
用途不同。小葉紫檀因其美麗的外觀、耐磨性和相對較硬的特性，常被用於製作木製工藝品、家具和樂器；黑檀木由於其硬度極高和美觀性，也被用於製作高檔家具、樂器、黃金雕刻等。
價格不同。由於採伐難度大和生長地理位置有限，黑檀木通常比小葉紫檀更昂貴。